Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfrp2P97299 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp2P97299 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp2P97299 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms