Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim43cP86449 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim43cP86449 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim43cP86449 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms