Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gabpb2P81069 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabpb2P81069 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabpb2P81069 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms