Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tp53bp1P70399 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tp53bp1P70399 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tp53bp1P70399 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 262.1 ms