Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad50P70388 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rad50P70388 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad50P70388 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad50P70388 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad50P70388 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rad50P70388 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad50P70388 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad50P70388 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms