Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HfeP70387 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HfeP70387 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HfeP70387 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HfeP70387 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HfeP70387 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HfeP70387 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HfeP70387 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HfeP70387 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HfeP70387 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HfeP70387 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HfeP70387 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HfeP70387 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HfeP70387 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HfeP70387 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HfeP70387 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HfeP70387 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HfeP70387 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HfeP70387 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HfeP70387 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HfeP70387 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HfeP70387 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HfeP70387 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HfeP70387 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HfeP70387 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms