Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfi1P70338 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfi1P70338 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfi1P70338 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms