Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad54lP70270 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad54lP70270 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad54lP70270 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad54lP70270 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms