Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtgdrP70263 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtgdrP70263 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtgdrP70263 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms