Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Plxna3P70208 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Plxna3P70208 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Plxna3P70208 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plxna3P70208 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms