Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SbdsP70122 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SbdsP70122 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SbdsP70122 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SbdsP70122 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 560.9 ms