Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snrpd1P62315 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snrpd1P62315 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snrpd1P62315 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snrpd1P62315 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms