Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp46P62069 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp46P62069 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp46P62069 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp46P62069 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp46P62069 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms