Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Depdc5P61460 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Depdc5P61460 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Depdc5P61460 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Depdc5P61460 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms