Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf13P61216 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf13P61216 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf13P61216 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf13P61216 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf13P61216 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms