Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Actr1aP61164 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Actr1aP61164 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Actr1aP61164 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms