Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp1P60335 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp1P60335 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp1P60335 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms