Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rin3P59729 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rin3P59729 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rin3P59729 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rin3P59729 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rin3P59729 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rin3P59729 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms