Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Senp1P59110 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Senp1P59110 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Senp1P59110 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Senp1P59110 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Senp1P59110 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Senp1P59110 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Senp1P59110 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms