Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Csrnp3P59055 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Csrnp3P59055 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csrnp3P59055 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csrnp3P59055 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms