Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P58686 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P58686 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P58686 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P58686 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P58686 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P58686 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P58686 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P58686 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P58686 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P58686 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P58686 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P58686 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P58686 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P58686 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P58686 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P58686 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P58686 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P58686 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P58686 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P58686 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P58686 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P58686 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P58686 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P58686 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P58686 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P58686 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms