Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr8P58682 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr8P58682 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr8P58682 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr8P58682 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms