Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctdsp1P58466 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp1P58466 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctdsp1P58466 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms