Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snrpa1P57784 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snrpa1P57784 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snrpa1P57784 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snrpa1P57784 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms