Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rp1P56716 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rp1P56716 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rp1P56716 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rp1P56716 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rp1P56716 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp1P56716 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rp1P56716 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms