Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TdgP56581 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TdgP56581 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TdgP56581 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TdgP56581 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TdgP56581 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TdgP56581 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TdgP56581 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TdgP56581 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TdgP56581 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TdgP56581 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TdgP56581 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdgP56581 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdgP56581 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdgP56581 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdgP56581 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdgP56581 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TdgP56581 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TdgP56581 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TdgP56581 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TdgP56581 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TdgP56581 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdgP56581 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdgP56581 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TdgP56581 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdgP56581 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdgP56581 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdgP56581 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdgP56581 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdgP56581 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TdgP56581 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdgP56581 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdgP56581 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdgP56581 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TdgP56581 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TdgP56581 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdgP56581 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdgP56581 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdgP56581 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TdgP56581 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TdgP56581 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TdgP56581 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TdgP56581 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdgP56581 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdgP56581 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdgP56581 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TdgP56581 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdgP56581 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TdgP56581 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms