Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lim2P56563 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lim2P56563 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lim2P56563 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lim2P56563 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lim2P56563 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lim2P56563 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lim2P56563 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms