Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctbp2P56546 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctbp2P56546 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctbp2P56546 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctbp2P56546 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctbp2P56546 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctbp2P56546 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctbp2P56546 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms