Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cox6b1P56391 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cox6b1P56391 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cox6b1P56391 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms