Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5g3P56384 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5g3P56384 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5g3P56384 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms