Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GferP56213 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GferP56213 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GferP56213 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GferP56213 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GferP56213 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GferP56213 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GferP56213 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GferP56213 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GferP56213 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GferP56213 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GferP56213 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GferP56213 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GferP56213 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GferP56213 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GferP56213 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GferP56213 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GferP56213 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GferP56213 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GferP56213 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GferP56213 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GferP56213 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms