Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex2P55098 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex2P55098 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex2P55098 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex2P55098 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex2P55098 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pex2P55098 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pex2P55098 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pex2P55098 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms