Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aqp4P55088 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aqp4P55088 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms