Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ephb3P54754 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ephb3P54754 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb3P54754 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms