Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Faf1P54731 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Faf1P54731 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faf1P54731 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faf1P54731 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faf1P54731 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Faf1P54731 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faf1P54731 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms