Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nub1P54729 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nub1P54729 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nub1P54729 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nub1P54729 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nub1P54729 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nub1P54729 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nub1P54729 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms