Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp10P52479 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp10P52479 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp10P52479 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp10P52479 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp10P52479 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms