Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Apobec1P51908 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec1P51908 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec1P51908 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms