Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc1a1P51906 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc1a1P51906 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a1P51906 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms