Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr5P51682 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr5P51682 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccr5P51682 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccr5P51682 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms