Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CastP51125 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CastP51125 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CastP51125 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CastP51125 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CastP51125 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CastP51125 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CastP51125 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CastP51125 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CastP51125 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CastP51125 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CastP51125 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CastP51125 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CastP51125 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CastP51125 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CastP51125 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CastP51125 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CastP51125 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CastP51125 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CastP51125 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CastP51125 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CastP51125 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CastP51125 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CastP51125 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CastP51125 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CastP51125 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CastP51125 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CastP51125 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CastP51125 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CastP51125 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CastP51125 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CastP51125 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CastP51125 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CastP51125 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CastP51125 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CastP51125 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CastP51125 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CastP51125 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CastP51125 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CastP51125 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CastP51125 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CastP51125 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CastP51125 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CastP51125 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CastP51125 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CastP51125 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CastP51125 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CastP51125 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms