Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa10P50708 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa10P50708 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa10P50708 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa10P50708 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa10P50708 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa10P50708 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa10P50708 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa10P50708 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa10P50708 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa10P50708 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa10P50708 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Defa10P50708 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa10P50708 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa10P50708 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa10P50708 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa10P50708 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa10P50708 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa10P50708 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa10P50708 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa10P50708 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa10P50708 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa10P50708 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa10P50708 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa10P50708 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa10P50708 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa10P50708 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa10P50708 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa10P50708 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa10P50708 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms