Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FanccP50652 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FanccP50652 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FanccP50652 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FanccP50652 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FanccP50652 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FanccP50652 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FanccP50652 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FanccP50652 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FanccP50652 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanccP50652 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FanccP50652 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanccP50652 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanccP50652 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FanccP50652 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanccP50652 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanccP50652 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FanccP50652 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FanccP50652 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FanccP50652 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanccP50652 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanccP50652 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanccP50652 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanccP50652 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FanccP50652 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanccP50652 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanccP50652 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FanccP50652 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanccP50652 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FanccP50652 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FanccP50652 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanccP50652 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanccP50652 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FanccP50652 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FanccP50652 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FanccP50652 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FanccP50652 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FanccP50652 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FanccP50652 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms