Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TspoP50637 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TspoP50637 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TspoP50637 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TspoP50637 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TspoP50637 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TspoP50637 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TspoP50637 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TspoP50637 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TspoP50637 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TspoP50637 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TspoP50637 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TspoP50637 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TspoP50637 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TspoP50637 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TspoP50637 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TspoP50637 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TspoP50637 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TspoP50637 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TspoP50637 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TspoP50637 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TspoP50637 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TspoP50637 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TspoP50637 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TspoP50637 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TspoP50637 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TspoP50637 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TspoP50637 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.3 ms