Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdi1P50396 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdi1P50396 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdi1P50396 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms