Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxc13P50207 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxc13P50207 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxc13P50207 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxc13P50207 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms