Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtshP49935 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtshP49935 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtshP49935 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtshP49935 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtshP49935 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtshP49935 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtshP49935 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtshP49935 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtshP49935 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtshP49935 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CtshP49935 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtshP49935 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CtshP49935 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtshP49935 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtshP49935 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtshP49935 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtshP49935 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtshP49935 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtshP49935 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtshP49935 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtshP49935 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtshP49935 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtshP49935 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtshP49935 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtshP49935 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtshP49935 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtshP49935 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtshP49935 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtshP49935 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtshP49935 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtshP49935 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtshP49935 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtshP49935 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtshP49935 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms