Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CitP49025 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CitP49025 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CitP49025 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CitP49025 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CitP49025 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CitP49025 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CitP49025 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CitP49025 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CitP49025 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CitP49025 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CitP49025 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CitP49025 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CitP49025 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CitP49025 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CitP49025 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CitP49025 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CitP49025 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CitP49025 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CitP49025 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CitP49025 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CitP49025 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CitP49025 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CitP49025 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CitP49025 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CitP49025 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CitP49025 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CitP49025 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CitP49025 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CitP49025 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CitP49025 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CitP49025 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CitP49025 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CitP49025 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CitP49025 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CitP49025 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms