Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atoh1P48985 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atoh1P48985 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atoh1P48985 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms