Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox8bP48772 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox8bP48772 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox8bP48772 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms